Уникальная особенность такоего лазера - способность благодаря высокой мощности выполнить задачу взаимодействия с целью, сделав это без передачи тепла на окружающую область, что обеспечивается краткостью импульса. Фемтосекундный лазер может разрушать мельчайшие цели, например, раковые клетки, без ущерба для соседних здоровых - ученые надеются, что в онкологии лазеры со временем заменят чрезвычайно вредную для организма химиотерапию. Среди потенциальных применений фемтосекундного лазера также - прецизионные разрезы, высоконадежные швы и формирование сверхчистых каналов в кремниевых "лабораториях на кристалле", а в стоматологии фемтолазером можно было бы лечить кариес, не разрушая здоровую ткань зуба.