Как указывают в Microsoft, если кто-то из поставщиков мобильных устройств будет возражать против комплектации операционной системы офисными приложениями, об их исключении можно будет договориться на индивидуальной основе. Среди других новшеств Windows Mobile 6 - обновленная версия технологии Direct Push, обеспечивающая автоматическую синхронизацию календарей, задач и контактов Outlook с сервером Exchange. В ОС также появилась возможность дистанционного уничтожения всех данных сетевым администратором в случае утраты устройства пользователем. Поддерживается также возможность шифрования данных на карте хранения. Кроме того, в ОС встроена мобильная версия платформы .Net Compact Framework для доступа к корпоративным бизнес-приложениям.