Возможности NOD32 Enterprise Edition позволяют обнаруживать и уничтожить все виды вирусов, в том числе, написанные с учетом особенностей работы информационной системы конкретной организации, а также предоставляют защиту от шпионских, троянских и других вредоносных программ. Централизованное управление и настройка системы на удаленных серверах и рабочих станциях осуществляется при помощи встроенного модуля Remote Administrator. Система Eset NOD32 Enterprise Edition была также внедрена в компании <Уренгойгазпром>, дочернем предприятии <Газпрома>. Комплекс работ по реализации данного проекта на 400 машин осуществила фирма Leta.