Computerworld, США

Цель генетико-географического проекта Genographic — составить историческую карту переселения народов мира
Проект, начатый Национальным географическим обществом США совместно с корпорацией IBM, поможет составить карту миграций народов Земли

Национальным географическим обществом США совместно с корпорацией IBM начат поистине грандиозный пятилетний проект Genographic, в рамках которого предстоит собрать сотни тысяч образцов человеческой ДНК и по результатам их анализа составить карту маршрутов, по которым на протяжении веков происходила миграция племен и народов Земли. IBM в проекте отводится роль разработчика специализированного программного обеспечения для сбора и анализа данных и координатора деятельности участвующих в Genographic Project исследовательских учреждений.

«Проект начался совсем недавно, — сообщил старший менеджер Центра вычислительной биологии IBM Аджай Ройюру. — Его осуществление представляется мне делом устрашающе сложным. Предстоит, в частности, собрать личные анкеты и пробы крови свыше 100 тыс. представителей различных национальностей. Нашим исследователям, вооруженным специальными упрочненными ноут?буками, придется собирать информацию в самых разных уголках мира, пройти с ними джунгли и пустыни».

Ведущий инженер IBM Питер Родригес решил собственноручно оценить результаты проекта, предоставив пробы своей ДНК ученым для генетического анализа. Результаты его удивили.

«Я испанец, но исследование ДНК показало, что в ней преобладают следы балканских народностей, норвежских викингов, и, возможно, кельтов», — говорит Родригес. — Выходит, кто-то из них около 20 тыс. лет назад переселился в Испанию».

Делая объявление о начале инициативы в апреле этого года, директор проекта Спенсер Уэллс, штатный исследователь Национального географического общества, сравнил его по значимости с первым запуском космического спутника, сообщив, что цель Genographic Project состоит в том, чтобы заполнить существующие пробелы в понимании истории человечества.

По словам Ройюру, проект также поможет в выяснении происхождения языков, в результате чего, возможно, в корне изменятся принципы их преподавания.

«Нашим системным администраторам еще ни разу не приходилось сталкиваться с необходимостью проведения столь обширной работы по сбору данных, — подчеркнул Родригес. — Не исключено, что в ходе проекта ими будет получен какой-то новый интересный опыт. Десяти университетам предстоит поработать над сбором и анализом данных. Каждый из них до сих пор пользовался своими методиками и инструментариями, и их необходимо будет как-то объединять».

Для объединения разнородных систем разработано специализированное программное обеспечение, в котором для интеграции данных применяется подмножество XML под названием BioSystem Markup Language. Исследователи получат в свое распоряжение ноутбуки, работающие под управлением ОС Linux. Их пользователи должны будут сохранять и отправлять информацию в разбросанные по миру научные лаборатории, которые затем перешлют данные в центр обработки, находящийся в штаб-квартире Национального географического общества в Вашингтоне.

В лабораториях будет проводиться секвенирование каждого из образцов ДНК и преобразование результатов вместе с данными по фенотипу добровольца-участника (цвет волос, глаз, кожи и т. д.) в XML-объект, который и будет передан в Вашингтон в сопровождении географических координат места интервьюирования.

Параллельно с полевыми исследованиями в рамках проекта запланировано проведение Internet-программы, принять участие в которой сможет любой желающий изучить свою миграционную «родословную». Для этого необходимо будет заказать, заплатив 100 долл., комплект участника и предоставить одной из лабораторий ротовой мазок для исследования, результаты которого будут храниться анонимно в зашифрованном виде.

Общую стоимость проекта Ройюру оценивает в 40 млн. долл. — в основном, по его словам, это средства, необходимые на зарплату многочисленным исследователям. «Весьма познавательным испытанием для IBM оказалась разработка программного обеспечения для Genographic Project», — добавил он.

«Полученными уроками мы, несомненно, воспользуемся в других проектах», — говорит Ройюру.

Поделитесь материалом с коллегами и друзьями