Ранее руководство BayStar заявляло, что Microsoft всего лишь выполнила роль посредника, посоветовав SCO заключить договор с BayStar. Однако как утверждает член правления BayStar Ларри Голдфарб, корпорация при этом еще и поручилась за часть 50-миллионного вложения в SCO, сделанную BayStar. Однако после того как BayStar внесла деньги, в Microsoft перестали отвечать на звонки из инвестиционной компании, а топ-менеджер Microsoft, пообещавший денежные гарантии, как говорит Голдфарб, был, по всей видимости, уволен. Позднее BayStar продала инвестицию в SCO себе в убыток, поскольку та слишком активно расходовала средства. Представитель Microsoft в интервью The Wall Street Journal заявил, что подобных гарантий корпорация никогда BayStar не давала. Между тем участие Microsoft во вложении означало бы, что корпорация помогала SCO вести процесс против IBM, чтобы сдержать рост применения Linux, представляющий угрозу бизнесу Microsoft.