Движение поездов в ней полностью контролируется компьютерами, а машинисты присутствуют лишь на случай непредвиденных ситуаций. Поначалу такие ситуации возникали регулярно — на компьютерной схеме BART постоянно появлялись отсутствующие поезда-«призраки», а реальные из-за намокания сигнальных проводов могли «исчезать». В таких случаях скорость движения приходилось сильно замедлять и переходить на ручное управление.