MIIS жалуются на чрезмерную сложность инструментария, и на 2007 год запланирован выпуск новой версии, обещающей сделать конфигурирование и развертывание сервера более простым. Тем временем эту задачу берет на себя программный продукт MissionControl 2.0, предлагаемый фирмой NetPro. Система осуществляет функции мониторинга, диагностики и аудита работы MIIS, обладая графическим пользовательским интерфейсом наподобие Outlook.