Чтобы воспользоваться Xen в ее нынешнем виде, необходимо установить специальную заплату для ядра, что в случае использования коммерческого дистрибутива приведет к потере его поддержки со стороны производителя. Пока Xen не позволяет устанавливать на виртуальные машины Windows в качестве гостевой ОС, но в дальнейшем такую возможность планируется реализовать, воспользовавшись специальным расширением набора команд процессоров Intel.