Набор международных стандартов, определяющих правила обмена информацией в медицине, давно известен разработчикам медицинских информационных систем и производителям медицинского оборудования. Однако интеграция медицинской информации по-прежнему является сложнейшей проблемой информатизации здравоохранения.
Процесс создания Единой государственной информационной системы здравоохранения вошел в нелегкую фазу — интеграционную. Одновременно с внедрением в государственных и муниципальных лечебных учреждениях электронных медкарт идет интеграция локальных медицинских информационных систем с региональными и федеральными компонентами ЕГИСЗ, а также с приложениями для многочисленных мониторингов. Главная задача текущего года — наладить полноценный обмен данными в автоматическом, а не в ручном режиме. Наибольшие трудности вызывает обмен данными с системой ведения интегрированных электронных медкарт, в ней должна аккумулироваться информация из электронных медкарт медучреждений. Для этого в государственных учреждениях должны перейти на хранение информации в правильно структурированных файлах. Свои задачи решают и негосударственные лечебные предприятия — частные и ведомственные. Им, как правило, нужны не такие крупные системы, как государственным, но зато более специализированные и дешевые.