Watson поможет лечить рак мозга

Watson планируется использовать в рамках научного исследования — он будет помогать медикам Нью-Йоркского геномного центра сопоставлять мутации, обнаруженные у пациентов, с геномными базами данных и медицинской литературой. Результаты компьютер будет предоставлять лечащему врачу.

В исследовании участвуют пациенты с глиобластомой, быстроразвивающейся злокачественной опухолью головного мозга, из-за которой в США ежегодно погибают больше 13 тыс. человек.

Обычно онколог составляет план лечения для конкретного пациента, руководствуясь медицинской литературой, отмечает Сингх. Прототип сервиса на основе Watson будет помогать в этом процессе, автоматически предоставляя ссылки на соответствующие научные доклады.

Сам Watson работает в облаке IBM. Врачи будут загружать в него генную последовательность, а суперкомпьютер — просматривать базы данных и медицинскую литературу в поисках сведений о выявленных мутациях, коррелируя и выделяя найденные соответствия, которые могут быть полезными.

Программное обеспечение, реализующее эти возможности, было разработано еще раньше, чем Watson. Систему развивают уже около десяти лет в центре вычислительной биологии исследовательского подразделения IBM. «Сегодня пришло время заставить ее работать в автоматическом режиме и с информацией о реальных пациентах», — отметил Сингх.

IBM уже не впервые находит работу для Watson в области онкологических исследований. В 2012 году специалисты корпорации в сотрудничестве с раковым центром Memorial Sloan-Kettering в Нью-Йорке занялись созданием компьютерного ассистента для медиков.

Этот проект все еще реализуется, но IBM не уточняют, на каком он сейчас этапе. По-видимому, одним из его плодов стал коммерческий программный продукт Care Reviewer, выпущенный страховой компанией WellPoint, — система содействия в постановке диагноза.

Изначально Watson был разработан для совместного с людьми участия в телевикторине Jeopardy! (на основе которой в России создали шоу «Своя игра»). Суперкомпьютер понимает вопросы, заданные вслух обычным языком, и ищет на них ответы по множеству источников структурированной и неструктурированной информации.

После победы суперкомпьютера в Jeopardy! в IBM занялись коммерциализацией технологий Watson в ряде отраслей, в том числе в здравоохранении и послепродажном обслуживании.

Но у корпорации, похоже, есть сложности с адаптацией суперкомпьютера для более широкого применения. В частности, в доработке нуждается механизм поиска с разрешением неоднозначностей и сопоставлением сущностей (Entity Disambiguation and Matching), отвечающий за соотнесение разных описаний одного и того же объекта. На сегодняшний день EDM остается узким местом таких диалоговых медицинских систем, как Watson, отметил один из его разработчиков, Крис Уэлти.

Главная задача суперкомпьютера в новом проекте — верно сопоставить индивидуальные генетические мутации пациента с публикациями, где эти или похожие мутации описываются.

«Мутации могут быть весьма сложными, но со временем будут появляться исследования, позволяющие найти индивидуальное лечение для все большего числа случаев», — полагает Сингх.

По его словам, Watson, как самообучающаяся система, со временем будет все лучше справляться с выдачей верной информации. «Работая с пациентами, мы будем сохранять сведения о результативности лечения различными медикаментами, помогая суперкомпьютеру улучшать точность своих ответов», — добавил он.

Сингх утверждает, что Watson будет обучаться быстро: «Мы уверены, что сможем начать предоставлять сервис на коммерческой основе уже через несколько месяцев».

Нью-Йоркский геномный центр — это некоммерческий научно-исследовательский институт и лечебное учреждение, финансируемое консорциумом научных и медицинских организаций, в том числе центром Memorial Sloan-Kettering, Нью-Йоркским университетом и Рокфеллеровским университетом.